Que ce soit en laboratoire, dans l'industrie, dans les organismes de contrôles, les élèves du cursus sont préparés à respecter des conditions d'hygiène et de sécurité drastiques dans leur future vie professionnelle. Ils vont devoir apprendre comment fonctionne une ligne de production et les différentes étapes de transformation des aliments et des matières premières agricoles, toutes les mesures d'hygiène, les normes, les process de contrôle de conformité qui assurent la sécurité alimentaire aux consommateurs.
Qu'ils deviennent ouvrier conditionneur, ouvrier d'abattoir, animalier, technicien d'analyses sensorielles, contrôleur qualité, ils auront reçu une formation appropriée, dans des structures conçues pour les travaux pratiques, avec des contacts fréquents avec des professionnels lors des stages en entreprise ou visites de terrain. C'est en effet l'une des qualités des lycées agricole d'être très bien inséré dans leur territoire et de répondre non seulement aux attentes des branches professionnelles mais aussi aux besoins locaux en terme de formation.